สำหรับ ShyFile นั้น จะใช้ key ที่มีความยาวจาก 32 ตัวอักษรจนถึง 1024 ตัวอักษร ซึ่งอาจจะเป็นข้อความที่ user กำหนดขึ้นเอง หรือ เป็นข้อความ random ที่ทางโปรแกรมทำการ generate ขึ้นมาให้ หรืออาจจะเป็น file อะไรก็ได้ โดย shyfile จะนำข้อมูลใน file นั้นมาเป็น seed ของการทำ encryption ข้อความที่ถูกทำการเข้ารหัสโดย shyfile จะมี key ถอดรหัสเพียงแค่ key เดียว คือ key ที่ใช้เข้ารหัส ทำให้ข้อมูลที่ถูก encrypt ปลอยภัยมากยิ่งขึ้น นอกจากนั้นทาง ShyFile ยังไม่มี master key ที่สามารถถอดรหัสได้ทุกข้อความ หรือ ระบบกู้ key ใดๆ ทั้งสิ้น เพราะฉะนั้น ถ้า key ที่ถูกใช้เข้ารหัสศูนย์หาย ก็จะไม่สามารถทำการถอดรหัสข้อมูลได้อีกต่อไป